你好，我就是搞预决算的。我可以回答你。
1、监理费及预算、审计费（不知道是不是你说的决算费）都应由业主单位支付（合同单独注明的除外）。
2、改造工程款的支付，要看你们合同中签订的是以总价包干的形式计算还是按实结算，如果是包干，那你当然就不用付那6000元，如果是按实结算，在材料款中你们由已经签字认同了，那么你们就必须支付多出的6000元。
3、合同中未注明的款项可以参照标准合同通用条款或者相关文件来确定（这个只有你具体问题具体分析咯）。